Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms