Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms