Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TgfaP48030 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TgfaP48030 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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