Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf9P41274 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.8 ms