Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms