Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa10P31310 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms