Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprmP28828 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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