Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PdgfraP26618 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PdgfraP26618 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PdgfraP26618 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PdgfraP26618 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PdgfraP26618 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PdgfraP26618 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PdgfraP26618 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PdgfraP26618 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
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PdgfraP26618 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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