Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd12P23812 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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