Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eif3aP23116 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms