Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clk1P22518 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clk1P22518 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clk1P22518 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clk1P22518 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clk1P22518 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clk1P22518 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clk1P22518 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Clk1P22518 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clk1P22518 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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