Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms