Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P20040 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P20040 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms