Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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PcnaP17918 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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PcnaP17918 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
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PcnaP17918 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms