Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms