Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P04212 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P04212 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P04212 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P04212 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P04212 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P04212 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P04212 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P04212 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P04212 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P04212 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P04212 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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P04212 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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P04212 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P04212 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
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