Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ColqO35348 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ColqO35348 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ColqO35348 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ColqO35348 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ColqO35348 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ColqO35348 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ColqO35348 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ColqO35348 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
ColqO35348 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ColqO35348 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ColqO35348 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ColqO35348 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ColqO35348 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ColqO35348 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ColqO35348 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ColqO35348 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ColqO35348 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms