Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms