Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20795J3QP49 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20795J3QP49 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20795J3QP49 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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Gm20795J3QP49 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20795J3QP49 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20795J3QP49 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20795J3QP49 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20795J3QP49 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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Gm20795J3QP49 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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Gm20795J3QP49 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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Gm20795J3QP49 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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