Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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