Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf148G3X9R7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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