Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Colca2F8VPY8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Colca2F8VPY8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Colca2F8VPY8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Colca2F8VPY8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Colca2F8VPY8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Colca2F8VPY8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Colca2F8VPY8 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Colca2F8VPY8 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Colca2F8VPY8 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Colca2F8VPY8 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Colca2F8VPY8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Colca2F8VPY8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Colca2F8VPY8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Colca2F8VPY8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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