Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms