Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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