Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8247F6VRJ8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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