Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 AC160991.2-201ENSMUST00000223784 1135 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms