Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B3

Uncharacterized membrane protein C3orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9Q0B3 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm5409-201ENSMUST00000160346 698 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E9Q0B3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms