Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms