Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc8E9PWG2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms