Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm3298E9PW80 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm3298E9PW80 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm3298E9PW80 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3298E9PW80 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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