Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms