Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmf1B9EKI3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmf1B9EKI3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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