Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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