Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms