Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rrn3B2RS91 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rrn3B2RS91 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Rrn3B2RS91 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Rrn3B2RS91 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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