Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms