Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ssxb8B1AY40 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ssxb8B1AY40 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ssxb8B1AY40 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ssxb8B1AY40 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ssxb8B1AY40 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ssxb8B1AY40 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssxb8B1AY40 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms