Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Atp8b5A3FIN4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Atp8b5A3FIN4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Atp8b5A3FIN4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Atp8b5A3FIN4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp8b5A3FIN4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp8b5A3FIN4 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp8b5A3FIN4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atp8b5A3FIN4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atp8b5A3FIN4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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