Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Prdm16A2A935 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms