Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm2A2A7B5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm2A2A7B5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm2A2A7B5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm2A2A7B5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm2A2A7B5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm2A2A7B5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm2A2A7B5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm2A2A7B5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm2A2A7B5 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm2A2A7B5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.2 ms