Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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