Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cib1Q9Z0F4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms