Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nphp1Q9QY53 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nphp1Q9QY53 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms