Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Chaf1aQ9QWF0 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms