Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PolkQ9QUG2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms