Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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