Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rabgef1Q9JM13 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rabgef1Q9JM13 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rabgef1Q9JM13 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rabgef1Q9JM13 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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