Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Tgm1Q9JLF6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Tgm1Q9JLF6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Tgm1Q9JLF6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Tgm1Q9JLF6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms