Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx3Q9JKB3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms