Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn2Q9ER65 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms